После вторжения инфицированной клетки в хромосому, частицы вирусов становятся пассивными и невидимыми для нашей иммунной системы. Поэтому терапия не может полностью уничтожить вирус. ВИЧ остаётся "бомбой замедленного действия" в организме, потому что в любое время латентный вирус может пробудиться и перезапустить цикл инфекции. Многие современные методы лечения пытаются добиться реактивации скрытого вируса, чтобы "натравить" на него иммунитет. Но, к сожалению, ни один из них не доказал свою эффективность для полного излечения инфицированных пациентов. Чужеродный ДНК скрывается в хроматине (вещество хромосом, комплекс ДНК, РНК и белков – прим.) инфицированных Т-клеток.
Группа исследователей разработала технологию, направленную на выявление роли хроматина в "молчании" латентного ВИЧ в ответ на современную терапию. По сообщению Nature Structural and Molecular Biology, технология называется B-HIVE. Она позволила учёным найти "вставки" ВИЧ в геноме человека и измерить уровень их экспрессии на поверхности клеток.
"Мы расставили "штрих-коды" на группе вирусов. С помощью этих штрих-кодов, мы смогли связать отдельный вирус с его местом в хромосоме", – объяснил Гийом Филион, ведущий автор этого исследования. Генетическое кодирование работает как штрих-коды продуктов в супермаркетах: после того, как все элементы помечены, каждый из них может быть идентифицирован по индивидуальному коду. "Кроме того, мы смогли измерить уровень экспрессии вируса и показали, что реакция ВИЧ на реактивационную терапию частично зависит от сайта интеграции (место в хромосоме, куда может встроиться чужеродная ДНК – прим.) в геноме человека. Это демонстрирует практическую значимость хроматина в борьбе с ВИЧ", – заявил исследователь.
При использовании новой технологии, исследователи смогли показать, как препараты реактивируют ВИЧ в различных точках в пределах хромосомы. Оказалось, что воздействие этих препаратов более избирательно, чем считалось ранее. "Обладая такой техникой, мы сможем найти наилучшее сочетание лекарственных средств, которые активизируют скрытые вирусы, до сих пор скрывавшиеся от антиретровирусных препаратов, и сделаем их более восприимчивыми к терапии. Наше исследование поможет разработчикам лекарственных средств", – говорит Хэн-Чанг Чен, исследователь CRG.
"Это большой шаг вперед, и, безусловно, стимуляция дальнейших исследований эффективности лечения ВИЧ, а также переосмысление "спящего" состояния вируса", – добавляет Андреас Мейеранс, профессор UPF.
