В течение многих лет учёные по всему миру исследовали капсид ВИЧ, поскольку он имеет необычную для вирусов конусообразную форму. Впервые, сложные структуры белков капсида визуализированы в самом вирусе. Для этого аспирант EMBL Симон Маттеи использовал криоэлектронную томографию (наблюдение под микроскопом замороженных образцов – прим.) в самбнанометрическом разрешении. Маттеи заглянул внутрь отдельных частиц ВИЧ, чтобы показать, как вирус защищает свой геном.
Исследования помогли сопоставить с реальностью математическую и компьютерную модели.
В 1990-х годах учёные впервые предположили, что ВИЧ-капсид имеет структуру фуллерена (молекулярное соединение в форме выпуклого и замкнутого многогранника, похожего на футбольный мяч. Каждая грань представляет собой пяти или шестиугольник – прим.) Предполагалось, что грани создают искривленную поверхность конического ВИЧ-капсида. Но никто не знал наверняка, как капсид выглядит в реальности и как белки изгибаются, чтобы сформировать конус.
"Симон рассмотрел сам вирус и получил данные о нём. Он смог увидеть белковую структуру и отдельные единицы, образующие коническую форму", – объясняет лидер группы EMBL Джон Бриггс.
Бриггс отметил, что ряд данных отличаются от тех, что учёные имели ранее. Например, есть отличия в структуре пентамера (полимер из пяти звеньев). Молекулярные узлы также отличаются от моделей.
Каждое из изображений Маттеи представляет собой снимок реального, целого вируса. Информация о капсиде ВИЧ открывает широкие возможности для поиска и моделирования новых путей воздействия на вирус. Она поможет определить новые стратегии в разработке лекарств.
