Главным нововведением стало расширение круга лиц, которые могут быть подвергнуты контролю. Если раньше проверки в основном касались иностранцев и лиц без гражданства, то теперь тестирование на возбудители инфекций может выборочно распространяться на всех прибывающих, включая граждан Российской Федерации. Решение о начале выборочных проверок принимает Роспотребнадзор или его территориальные органы, ориентируясь на текущую эпидемиологическую обстановку в стране, из которой прибыл человек. В зоне риска оказываются пассажиры из государств с неблагополучной ситуацией по инфекционным болезням, включая корь, лихорадку чикунгунья и другие. Тестирование проводится исключительно с письменного согласия гражданина или законных представителей для детей. Отбор биоматериала, включая мазки из носо- и ротоглотки и кровь, осуществляется прямо в пунктах пропуска или медпунктах, где пассажиры при этом заполняют специальную анкету.
Для исследований будут использоваться методы ускоренной диагностики, включая ПЦР и LAMP. Результаты экспресс-тестов готовятся за 15–30 минут, LAMP-исследования занимают до 4 часов, а стандартная ПЦР выполняется до 24 часов с момента доставки проб в лабораторию. При обнаружении инфекции информация незамедлительно передается в территориальные органы Роспотребнадзора для организации противоэпидемических мероприятий. Если пассажир к этому моменту уже покинул транспортный узел, мероприятия проводятся по месту его пребывания. Новый алгоритм предназначен для специалистов санитарно-карантинных пунктов, центров гигиены и эпидемиологии, а также может использоваться медучреждениями в регионах.