Белок pol играет ключевую роль на поздних стадиях репликации ВИЧ. Специалисты нашли новую уязвимость в вирусе, на которую можно воздействовать с помощью лекарств. «Было известно, что существует связь между этими ферментами, прежде чем ВИЧ-защита распадается. Визуализация структуры поля ВИЧ объясняет основу этого сложного механизма», — сказал автор исследования доктор Эдди Арнольд.
Pol расщепляется на три фермента — протеазу, обратную транскриптазу и интегразу. Вместе они помогают «собрать» зрелую форму вируса. Протеаза играет решающую роль в инициировании этого процесса, разрезая молекулу на другие компоненты. Но до этого ученые не понимали, как сама протеаза освобождается (сначала от более крупного полипротеина gag-pol ВИЧ, а затем от HIV Pol) для выполнения этой задачи. Сейчас они предположили, что протеаза инициирует процесс путем саморасщепления, отделяясь от остальной части молекулы, с помощью обратной транскриптазы и, возможно, интегразы.
Биологи использовали криогенный электронный микроскоп для определения трехмерной структуры молекулы белка pol. Так они поняли, что он представляет собой димер, то есть он образован двумя совместно связанными белками.
Помимо этого, в двусторонней структуре протеазный компонент pol слабо связан со структурой обратной транскриптазы. По мнению экспертов, им удалось выявить новую уязвимость ВИЧ, на которую можно было бы воздействовать с помощью лекарств. Они продолжат исследования в этой области и планируют обратить пристальное внимание на роль интегразы в сборке зрелой формы вируса во время репликации.