В начале ноября в южноафриканской провинции Гаутенг резко возросло число случаев заражения коронавирусом, преимущественно среди молодежи. До 20 ноября было секвенировано (описана подробная структура гена) 77 образцов вируса из Гаутенга, и во всех из них подтвердился новый штамм. 23 ноября вирусологи обнаружили еще четыре аналогичных генома — предположительно, из государства Ботсвана. Все четверо заразившихся были привиты.
В итоге 26 ноября ученые-вирусологи и Всемирная организация здравоохранения (ВОЗ) заявили о распространении в Южной Африке нового штамма COVID-19 — B.1.1.529.
B.1.1.529, получивший название «омикрон», уже распространился за пределы Южной Африки. Зафиксировано как минимум три случая заражения новым штаммом — в Гонконге (заболел прибывший из ЮАР), в Израиле (человек вернулся из Малави) и в Бельгии (вирус обнаружили у человека, посетившего Египет).
Сейчас в базе доступно более 100 геномов нового штамма COVID-19.
Необычный мутант
«Омикрон» имеет огромное число мутаций в белках, гораздо большее, чем все предыдущие штаммы, в том числе «дельта». В одном только гене S-белка (спайк-белок, который распознает клетки-хозяева и помогает вирусу проникать внутрь) обнаружено 32 мутации. Некоторые из них уже известны вирусологам по ранее исследованным штаммам, однако новые комбинации вызывают опасения. Изменения затрагивают почти все участки S-белка — места прикрепления к рецепторам клеток, участки, помогающие проникнуть в клетку, но главное — участки-мишени для антител. Это значит, что штамм, по всей вероятности, сможет легче заражать клетки, быстрее собираться в вирусные частицы и быть невидимым для иммунного ответа. Ученые пока не берутся давать оценку вирулентности и контагиозности штамма до предварительных исследований. Пока известно, как ведут себя мутации по отдельности, но неясно, как они будут действовать, проявляясь одновременно.
Обнаружить B.1.1.529 помогла одна из мутаций в спайк-белке. Стандартный ПЦР-тест выявляет три целевых гена коронавируса, но в «омикроне» из-за этой мутации тест «не видит» один них. Эту избирательную «слепоту» приняли за маркер нового штамма, и он определяется последующим секвенированием генома.
Возможная причина появления «омикрона» — подавленный иммунитет
Штамм B.1.1.529 не похож на своих предшественников. Вирусологи утверждают, что он произошел не от «дельты», а от более ранней разновидности вируса. Обычно новые штаммы отличаются от предшественников небольшим устойчивым набором мутаций, которые появляются при последовательных изменениях во время передачи от одного человека к другому. Появление целого «букета» мутаций, по мнению ученых, — следствие того, что вирус долгое время развивался в организме человека с иммунодефицитом — вероятно, с ВИЧ или с длительным течением коронавирусной инфекции. Иммунная система ВИЧ-положительного человека не способна полностью побороть вирус, и он может месяцами развиваться в организме. Самые слабые вирусные частицы все же погибают от атак иммунитета, но вместе с тем накапливаются частицы, несущие изменения, которые делают их более устойчивыми к иммунному ответу. Этот процесс сравнивают с экспресс-эволюцией вируса в пределах организма. Такая теория объясняет, почему «омикрон» — потомок исходного штамма В.1.1, который сейчас практически «вымер».
Ботсвана переживает одну из тяжелейших эпидемий ВИЧ/СПИДа в мире. При этом в Южной Африке крайне низкий процент вакцинации населения — в ЮАР привито 23%, а в Ботсване — 19,4%. Заведующий отделением интенсивной терапии больницы Криса Хани Барагваната, Рудо Мативха, утверждает, что 65% зараженных новым штаммом не были привиты, либо получили одну дозу вакцины.
Появлению «омикрона» могли косвенно способствовать закрытые границы — страны превратились в независимые инкубаторы коронавируса, причем наиболее «плодородны» для этого страны с низким уровнем вакцинации и большим числом людей с иммунодефицитом.
Исследования рисков и последствий
Главная задача ученых — отследить распространение B.1.1.529 в мире, понять, насколько сильно изменены его свойства и насколько тяжелым окажется течение инфекции. Сейчас способность вируса уклоняться от иммунитета исследуют в Университете Витватерсранда в Йоханнесбурге, где появились первые данные о штамме. Изучается трансмиссивность (способность передаваться от человека к человеку) вируса и его конкурентное взаимодействие со штаммом «дельта».
Исследования позволят изучить свойства В.1.1.529. Штамм планируют искусственно размножать в клетках и затем на этих зараженных клетках будут тестировать сыворотки переболевших и вакцинированных. Если окажется, что «омикрон» действительно способен уходить от антител, для борьбы с ним понадобятся новые типы вакцин и повторная вакцинация населения.
26 ноября группа экспертов Всемирной организации здравоохранения провела экстренное обсуждение и обозначила штамм B.1.1.529 как вызывающий опасения (VOC). Это максимальная степень опасности: такие варианты несут изменения, которые могут способствовать большей заразности или более тяжелому течению болезни.
В связи с этим уже появились рекомендации для стран усилить эпиднадзор, секвенировать геном вируса при новых заражениях и пополнять общедоступную базу данных, сообщая об очагах инфекции, и вести совместные лабораторные исследования.
Европейский центр по предотвращению и контролю заболеваний (ECDC) оценил риск распространения «омикрона» «от высокого до очень высокого». Глава Всемирной медицинской ассоциации (WMA) Франк Ульрих Монтгомери полагает, что «омикрон» будет заразен как «дельта» и опасен как Эбола.
Локдаун и закрытие границ
Власти Израиля, Сингапура и Великобритании уже составили список стран, запрещенных для посещения. В него вошли ЮАР, Лесото, Ботсвана, Зимбабве, Мозамбик, Намибия и Эсватини. Граждане, возвращающиеся из этих стран, будут изолированы на карантин от семи до десяти дней. Также приостановлено авиасообщение между этими странами. Правительство ЮАР пытается оспорить это решение.
Еврокомиссия также планирует приостановить авиасообщение, некоторые страны (Германия, Чехия) уже объявили о закрытии границ. В Чехии проверяют возможное появление «омикрона», а в Германии такой случай уже подтвержден — инфицированный вернулся из ЮАР, — однако окончательные результаты анализа еще не опубликованы.
В США анонсировали с 29 ноября приостановку путешествий в страны, где локализуется новый штамм.
В России с 28 ноября ограничат въезд иностранных граждан из южноафриканских стран и Гонконга.
Коллаж: Анна Лукьянова
