Тайлер Старр, биохимик из Онкологического исследовательского центра Фреда Хатчинсона в Сиэтле, и его соавторы решили разобраться в проблеме лечения Covid-19 антителами: некоторые варианты SARS-CoV-2 приобрели мутации, которые позволяют вирусу ускользнуть из-под контроля антител.
Исследователи изучили 12 антител, выделенных у людей, вылечившихся от Covid-19, совместно с компанией Vir Biotechnology из Сан-Франциско. Эти антитела прикрепляются к фрагменту вирусного белка, который связывается с рецепторами на клетках человека. Многие методы лечения антителами при инфекции SARS-CoV-2 захватывают один и тот же фрагмент белка, называемый рецепторсвязывающим доменом.
Ученые составили список из тысяч мутаций в связывающих доменах нескольких вариантов SARS-CoV-2. Они также каталогизировали мутации в связывающем домене десятков коронавирусов, подобных SARS-CoV-2, которые принадлежат к группе, называемой сарбековирусами. Наконец, они оценили, как все эти мутации влияют на способность 12 антител прикрепляться к связывающему домену.
Одно из антител, S2H97, выделялось своей способностью прикрепляться к связывающим доменам всех исследуемых сарбековирусов. S2H97, который авторы называют антителом к пансарбековирусу, смог предотвратить распространение ряда вариантов SARS-CoV-2 и других сарбековирусов среди клеток, растущих в лаборатории. Он также был достаточно мощным, чтобы защитить хомяков от инфекции SARS-CoV-2. «Это самое крутое антитело, которые мы описали», — говорит Старр.
Более пристальное изучение молекулярной структуры S2H97 показало, что он нацелен на ранее невидимую и хорошо скрытую область на связывающем домене — на участок, который выявляется только тогда, когда домен связывается с рецептором клетки. Старр отмечает, что молекулы, нацеленные на эту область связывающего домена, могут генерировать защиту от множества вирусов и однажды могут быть использованы в пансарбековирусных вакцинах.
Остальные 11 антител могут быть нацелены на множество вирусов, но чем эффективнее антитело блокирует проникновение в клетку самого раннего известного штамма SARS-CoV-2, тем с меньшим диапазоном вирусов оно может связываться. Команда ученых также обнаружила, что антитела, которые могут деактивировать широкий спектр вирусов, нацелены на участки связывающего домена, которые, как правило, не изменяются по мере развития вируса.
Хорошие новости: исследователи определили антитела, которые могут связываться с рядом сарбековирусов, сообщил Аринджай Банерджи, вирусолог из Университета Саскачевана в Саскатуне, Канада: «Самый большой вопрос, который остается, — что насчет вирусов, о существовании которых мы еще не знаем?»
Хотя ученые не могут проверить активность антител против неизвестного вируса, добавляет Банерджи, лекарства и вакцины от пансарбековирусов помогут подготовить мир к борьбе со следующим коронавирусом, который перейдет от дикой природы к человеку.