Чтобы определить штамм коронавируса у пациента, необходимо пройти несколько этапов, и на одном из них требуется дополнительная подготовка, позволяющая сделать собранный материал распознаваемым для специального прибора — секвенатора, рассказал руководитель научной группы разработки новых методов диагностики на основе технологий секвенирования ЦНИИЭ Роспотребнадзора Камиль Хафизов.
«Если выделение РНК проблем обычно не вызывает, и в России есть собственные производители необходимых для этого этапа реагентов, в том числе и наш Институт эпидемиологии, то вся дальнейшая часть эксперимента обычно полностью построена на зарубежных реактивах, и довольно дорогостоящих», — рассказал специалист «Известиям».
В качестве основы использовали набор реагентов ARTIC, созданный зарубежными исследователями. Российские ученые изменили эту панель с учетом новых штаммов. Эту систему уже используют в ЦНИИ эпидемиологии и других подразделениях Роспотребнадзора.
«Нововведение позволило увеличить пропускную способность лаборатории и сократить время от момента забора материала до загрузки геномной информации на специализированный портал VGARus [Virus Genome Aggregator of Russia, российская база данных генетического разнообразия коронавируса], сделав возможным эффективное отслеживание распространения вариантов вируса в стране», — сказал Хафизов.
Кроме того, новая система поможет улучшить работу с поврежденными при транспортировке или неверно взятыми образцами.