Амаду Умару Хама из Университета Экс-Марсель совместно со своими французскими коллегами исследовал останки людей, обнаруженные во время раскопок в бывшем аббатстве Сен-Пьер. В период с 2011 по 2012 год археологи нашли кости 12 человек, которые жили в в XIII–XVIII веках. Антропологи установили, что все они были мужчинами, которым на момент смерти было 30–60 лет.
Ученые решили изучить зубные пульпы у 10 человек. Оказалось, что в двух образцах тесты на антитела к альфа-коронавирусу HCoV-229E, бета-коронавирусам OC43 и SARS-CoV-2 дали положительный результат. Для проверки исследователи использовали масс-спектрометрию. Этот анализ подтвердил, что в биологическом материале обоих мужчин присутствовали характерные для коронавирусов пептиды.
В этих образцах ученые обнаружили и пептиды из девяти (IVLSEDYKK) и семнадцати (RGPEQTQGNFGDQELIR) остатков аминокислот. Первый оказался идентичен последовательностям в репликах свиного респираторного коронавируса, вируса трансмиссивного гастроэнтерита свиней и собачьего коронавируса. Вторая последовательность встречается в нуклеокапсидном белке бета-коронавирусов SARS-CoV-1, SARS-CoV-2, а также коронавирусе азиатского подковоноса (Rhinolophus affinis).
В образце одного мужчины присутствовал еще и пептид из десяти остатков аминокислот (AYNVTQAFGR). Эта последовательность зафиксирована в нуклеокапсидном белке SARS-CoV-2, коронавируса азиатского подковоноса, а также коронавируса летучих мышей BM48-31/BGR/2008.
Однако это не может указывать, как именно коронавирусы повлияли на здоровье погибших мужчин. Кроме того, патогены отличаются от современного коронавируса. Возможно, инфекция передалась этим людям от домашних или диких животных, например от домашних свиней, коров или благородных оленей, с которыми они контактировали.