Одна из причин, почему с ВИЧ так сложно бороться, — это высокая скорость рекомбинации вируса. Она обеспечивает обмен генетической информацией между штаммами и стимулирует эволюцию ВИЧ среди людей. Этот генетический обмен помогает вирусу уклоняться от иммунной системы и становиться устойчивым ко многим лекарствам.
Одним из важных, но недостаточно изученных этапов рекомбинации ВИЧ является коинфекция, при которой две разные вирусные частицы заражают одну и ту же клетку. Несмотря на многолетние исследования, у ученых еще нет понимания, может ли изменение скорости коинфекции привести к трансформации скорости рекомбинации.
Хотя исследования ВИЧ на клеточных культурах и мышах показали, что рост коинфекции связан с увеличением количества рекомбинантных вирусов, неизвестно, обнаруживается ли этот эффект у людей, живущих с ВИЧ.
Ученые США предположили, что люди с высокой вирусной нагрузкой будут иметь больше коинфицированных клеток, что приведет к повышенным показателям рекомбинаци. Чтобы исследовать эту гипотезу, они разработали новый подход под названием «Анализ рекомбинации через распад связей временных рядов» (RATS-LD), позволяющий количественно оценить рекомбинацию с использованием генетических ассоциаций между мутациями.
Эксперты установили, что среди людей с наименьшей вирусной нагрузкой скорость рекомбинации стандартная относительно существующих оценок. Однако среди образцов с самой высокой вирусной нагрузкой медианная оценка примерно в шесть раз выше.
Эти результаты показывают, что уровень рекомбинации ВИЧ может быть даже более высоким, чем предполагали исследователи ранее. Ученые также считают, что плотность населения может влиять на эффективную скорость рекомбинации в различных условиях.