Ключ к "успеху" вируса в том, что, проникая в клетку, он заставляет её создать маленькую капсулу на поверхности мембраны – эта капсула наполнена вирусными частицами. Затем она может "отпочковаться" и инфицировать другие клетки. При встрече со здоровой клеткой, оболочка капсулы распадается и вирусная РНК начинает действовать.
Известно, что в процесс отделения капсулы с частицами вируса вовлечен белковый комплекс, называемый Gag-протеин. Однако детали этого процесса на молекулярном уровне все еще были неизвестны. "Да, мы знали, как выглядит эта структура в готовом виде, но все детали процесса сборки были по большей части неизвестны", – говорит доктор химических наук Грегори Вот.
Получить снимок белкового комплекса методами визуализации на молекулярном уровне было затруднительно, поэтому Вот со своей командой создал компьютерную модель-симулятор Gag-протеина в действии. Моделирование позволило им настроить систему так, чтобы приблизиться к уровню молекулярного взаимодействия. Результаты были подтверждены экспериментально в лаборатории Дженнифер Липпинкотт-Шварц из Национального института здравоохранения США.
Им удалось создать модель недостающих частей комплекса Gag-протеина и настроить ее так, чтобы увидеть, как в процесс сборки белков вовлечены клеточные структуры при подготовке к отделению вируса от инфицированной клетки.
"Мы нашли ту самую Ахиллесову пяту. Надеемся, что вскоре сможем создать и лекарство, чтобы остановить накопление Gag-протеина и прогрессию вируса", – добавил автор исследования.
Перевод: Денис Чигиринов
Подписывайтесь на страницу СПИД.ЦЕНТРа в фейсбуке