Частицы ВИЧ-1 высвобождаются из инфицированных клеток в незрелой форме, они не могут заражать другие клетки. Основным строительным материалом служат около даух тысяч копий длинного стержнеобразного белка, называемого Gag. Чтобы стать заразным, вирус должен пройти процесс созревания. В этом участвует протеаза ВИЧ-1 (вирусный фермент), которая разрезает белок на мелкие частички, что провоцирует огромную структурную перестройку компонентов вируса.
Исследователи из Института биохимии Макса Планка смогли выяснить, как матричный белок перестраивается во время созревания в инфекционную частицу.
Для этого эксперты использовали криоэлектронные микроскопы и машинный анализ. Им удалось получить очень подробные 3D-модели вирусных белков. Оказалось, что перестройка матрицы запускается «спейсерным пептидом 2», который прилипает к ней и заставляет белок реструктурировать самого себя.
Спейсерный пептид 2 — это один из шести компонентов, образующихся при разрезании белка Gag, но его функция до сих пор была неизвестна. Связывание спейсерного пептида 2 с матричным белком позволяет вирусу быстрее сливаться с целевыми клетками.
«Вирусная матрица имеет карман в своей зрелой форме. Теперь мы знаем, что его образует спейсерный пептид 2», — поясняет Джеймс Стейси, первый автор исследования.